公益类科研院所是我省科技创新的重要力量，研究领域覆盖了农业、医药、林业、水利、海洋科学、信息科学、环境保护、交通、能源、水产等方面，长期以来对我省乃至全国的社会经济发展作出了重要贡献，如浙江省医学科学院研制的甲肝疫苗、浙江省农业科学院育成的水稻品种原丰早都曾获国家发明奖，为我国疾病控制和粮食生产作出卓越贡献。但我省公益类科研院所目前的发展面临许多突出的困难和问题，如经费不足、管理体制和运行机制不顺畅等，造成科研院所的研究工作创新能力、创新活力和创新动力不足，难以有效适应我省经济建设和社会发展的需要。
　　一、我省公益类科研院所发展中面临的主要问题
　　1．经费投入不足，R＆D经费占总支出比例低。经费不足是公益类科研院所普遍存在的现象，也是困扰公益类科研院所改革和发展的重要问题，表现为人员经费不足，导致科研人员待遇偏低，直接影响创造积极性；公用经费不足，难以维持正常运行，一些基础设施得不到及时有效的维护更新，仪器设备普遍老化落后；项目配套经费难以落实，影响科研项目顺利实施。
　　2．高层次科研人才匮乏，骨干人才流失严重。公益类科研院所领军人才稀少，高层次、创新型人才匮乏，骨干人才流失严重，创新能力强的科研团队难以形成。造成科研领军人才引进困难和骨干人才流失的主要原因首先是公益类科研院所内部激励不够，其次是公益类科研院所在待遇、科研条件、发展前景等方面的吸引力下降。
　　3．管理不够规范，运行机制不活。没有建立起一套既符合科技发展规律又与市场经济相适应的现代科技管理制度，如在用人制度上仍是“身份管理”，尚未全面推行真正意义上的聘用合同制管理，在分配机制上，未建立有效的分类薪酬制度和成果转化激励机制。
　　4．科研评价体系有待完善。基础应用研究岗位和技术服务岗位评价体系分界不清，科研人员绩效考评过多注重短期化、简单化的指标，如论文数等，缺乏对人才培养、团队发展、社会效益等可持续发展的指标，“一所（院）两制”实际上是“一人两制”，科技人员在从事社会公益研究的同时从事科技经营开发，不利于专业分工，也给考核评价带来困难。
　　5．缺乏团队培养体系。多数科研院所缺少硕士培养学位点，梯队建设和科研活力不足。
　　二、公益类科研院所发展的对策建议
　　为推进我省公益类科研院所改革，加快建立现代科研院所制度，提升科技创新和成果转化能力，推动全省科学发展，提出以下几点建议：
　　1．明确公益类科研院所职能定位。围绕国家重大需要，按照创新驱动发展战略要求，结合浙江省长期发展规划和产业需求，积极推进应用基础性研究和重大关键技术研究，将重点科研力量集中到国家战略需求和世界科技前沿,进一步明确不同类型公益类科研院所目标任务和分类定位，将缺乏市场能力又事关国计民生的，有特色、有优势的科研院所作为公益类科研院所的重点，尊重不同性质科技创新活动的特点和规律，建立与其科研活动规律相适应的管理和运行机制，让机构、人才、装置、资金、项目充分活跃起来，实现技术共享、设备共享、科研项目合作，形成推进科技创新发展的强大合力。
　　2．强化公益类科研院所条件保障。科研院所为科技创新主体，纯公益类科研院所保留事业单位性质并给予稳定支持，加大事业费和基本科研专项支持保障。专项经费用于支持公益类科研院所开展自主选题研究和科技创新平台建设，各项科技计划和平台建设按照竞争、择优的原则，向重点公益类院所倾斜。对公益性项目采取饱和长期支持方式，使科研人员潜心科研，提升原始创新能力。大力支持自主开展对外合作与交流。
　　3．加强公益类院所人才队伍建设。将公益类科研院所高层次人才纳入各级人才培养引进资助计划和建设项目，重点加强对高层次人才培养、紧缺人才引进、杰出人才的资助。对引进的科技领军人才，公益类科研院所可直接聘任特设岗位，不计入单位岗位结构比例。对优秀科研人员可实行低职高聘，所补的待遇差额由单位自筹解决。住房困难科技人员给予保障性住房等相关优惠政策。强化激励机制，公益类科研院所引进科技人才的补贴、获科技成果奖的奖金以及科技成果转化的个人收益不计入单位绩效工资总量，充分调动科研人员的积极性，充分激发创新活力。加强研究生培养和增设博士后流动站建设，扩大公益类科研院所硕、博招生规模。
　　4．不断完善公益类科研院所和人员绩效评价体系。建立创新综合绩效考评体系，不同性质公益类科研院所的目标任务不同，考核评价体系也不同。延长考核周期，采用国内外同行评议、团队发展、市场评价等绩效评价体系，打破唯SCI论，避免简单化、指标化、短期化的考核，创造潜心科研的良好学术氛围。特色研究所通过相关行业部门、地方政府评价为主；应用基础研究人员和科技服务人员实行分类考核评价。
　　5．完善科研成果转化和激励制度。支持公益类科研院所牵头组织或与企业联合申报各类科技计划项目。鼓励科研院所采取转让、许可、作价入股等方式转化科技成果，加速科技成果转化和产业化，将科研成果处置权全权下放给科研院所，更多激励对科技成果创造做出重要贡献的机构和人员；对科技成果完成人和为科技成果转化作出重要贡献人员的奖励不受事业单位绩效工资总额限制，进一步调动科技人员创新积极性。